20种标准氨基酸:结构、缩写与命名来源

汇总20种标准α-氨基酸的中英文名称、缩写、侧链结构、分类、命名来源及其在NCA合成中的意义。

核心框架 蛋白质中常见的 20 种标准 α-氨基酸(alpha-amino acid,氨基和羧基均连接在 α-碳上的氨基酸)可写成: H2NCH(R)COOH\mathrm{H_2N-CH(R)-COOH} 其中,α-碳同时连接氨基、羧基、氢和侧链 RR。侧链决定氨基酸的大小、极性、酸碱性、反应性及其在蛋白质中的作用。

一、总表

结构写法 表中的侧链以常见中性结构式表示;在生理 pH(约 7.4)下,氨基酸主体通常以 两性离子(zwitterion,同时带正、负电荷但净电荷可为零的离子)存在,部分侧链也会电离。

中文名英文名三字母单字母侧链 RR结构特点名称来源
甘氨酸GlycineGlyGH-H最小;α-碳连两个 H,因此无手性希腊语 glykys,意为“甜”,与其甜味有关
丙氨酸AlanineAlaACH3-CH_3甲基侧链;最简单的手性氨基酸历史名称与 aldehyde(醛)及早期由乙醛相关反应制备有关
缬氨酸ValineValVCH(CH3)2-CH(CH_3)_2异丙基;疏水;支链氨基酸valeric acid(戊酸,又称缬草酸)的命名体系相关
亮氨酸LeucineLeuLCH2CH(CH3)2-CH_2CH(CH_3)_2异丁基;疏水;支链氨基酸希腊语 leukos,意为“白色”,与早期得到的白色晶体有关
异亮氨酸IsoleucineIleICH(CH3)CH2CH3-CH(CH_3)CH_2CH_3仲丁基;疏水;有两个手性中心iso-(异构)+ leucine(亮氨酸),表示亮氨酸的结构异构体
丝氨酸SerineSerSCH2OH-CH_2OH伯醇羟基;极性;可形成氢键并被磷酸化拉丁语 sericum,意为“丝绸”,因最初从丝蛋白中分离
苏氨酸ThreonineThrTCH(OH)CH3-CH(OH)CH_3仲醇羟基;极性;有两个手性中心因结构与 threonic acid(苏糖酸)相近而命名
半胱氨酸CysteineCysCCH2SH-CH_2SH含巯基;可氧化形成二硫键名称源自胱氨酸 cystine;半胱氨酸是胱氨酸的还原单体形式
甲硫氨酸(蛋氨酸)MethionineMetMCH2CH2SCH3-CH_2CH_2SCH_3含硫醚;疏水;一般不形成二硫键名称反映其 methyl(甲基)thio(硫)结构特征
天冬氨酸Aspartic acidAspDCH2COOH-CH_2COOH侧链多一个羧基;生理 pH 下通常带负电由天冬酰胺水解得到;词源最终与 asparagus(芦笋)相关
谷氨酸Glutamic acidGluECH2CH2COOH-CH_2CH_2COOH比天冬氨酸多一个亚甲基;生理 pH 下通常带负电与早期对 gluten(面筋蛋白)的研究和分离有关
天冬酰胺AsparagineAsnNCH2CONH2-CH_2CONH_2天冬氨酸侧链羧基的酰胺;极性、不带电最早从 asparagus(芦笋)中分离,因而得名
谷氨酰胺GlutamineGlnQCH2CH2CONH2-CH_2CH_2CONH_2谷氨酸侧链羧基的酰胺;极性、不带电表示 glutamic acid(谷氨酸)的 amide(酰胺)形式
赖氨酸LysineLysK(CH2)4NH2-(CH_2)_4NH_2末端 ε-氨基;生理 pH 下通常带正电词根与希腊语 lysis(分解、溶解)相关,呼应其从蛋白质水解物中获得的历史
精氨酸ArginineArgR(CH2)3NHC(=NH)NH2-(CH_2)_3NHC(=NH)NH_2末端胍基;碱性强;生理 pH 下通常带正电通常认为与拉丁语 argentum(银)有关,可能源于早期使用银盐鉴定或分离
组氨酸HistidineHisHCH2-CH_2-咪唑环咪唑侧链的酸碱平衡接近生理范围,常参与酶催化和金属配位希腊语 histos,意为“组织”,与其从蛋白质/组织材料中分离的历史有关
苯丙氨酸PhenylalaninePheFCH2C6H5-CH_2C_6H_5苄基侧链;芳香、疏水phenyl(苯基)+ alanine(丙氨酸),直接描述其结构关系
酪氨酸TyrosineTyrYCH2C6H4OH-CH_2C_6H_4OH(对位羟基)酚羟基;芳香;可被磷酸化希腊语 tyros,意为“奶酪”,因最早从奶酪蛋白中获得
色氨酸TryptophanTrpWCH2-CH_2-吲哚环吲哚芳香环;体积大;可形成氢键名称反映其在 tryptic digestion(胰蛋白酶消化)产物中的发现历史
脯氨酸ProlineProP(CH2)3-(CH_2)_3- 回连 α-氨基 N形成五元吡咯烷环;α-氨基为仲胺;显著限制主链构象名称与其 pyrrolidine(吡咯烷)环结构及早期化学命名有关

20种标准氨基酸结构示意图

二、按侧链性质分类

1. 非极性与疏水侧链

  • 甘氨酸 Gly、丙氨酸 Ala、缬氨酸 Val、亮氨酸 Leu、异亮氨酸 Ile、甲硫氨酸 Met、脯氨酸 Pro。
  • 苯丙氨酸 Phe 和色氨酸 Trp 也常归入疏水芳香族氨基酸。
  • 缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸合称 BCAA(branched-chain amino acids,支链氨基酸)

2. 极性但通常不带净电荷的侧链

  • 丝氨酸 Ser、苏氨酸 Thr、半胱氨酸 Cys、天冬酰胺 Asn、谷氨酰胺 Gln。
  • 酪氨酸 Tyr 具有酚羟基,兼具芳香性和一定极性。

3. 酸性侧链

  • 天冬氨酸 Asp、谷氨酸 Glu。
  • 在生理 pH 下,侧链羧基通常去质子化,分别写作 COO-COO^-

4. 碱性侧链

  • 赖氨酸 Lys、精氨酸 Arg、组氨酸 His。
  • Lys 和 Arg 在生理 pH 下通常带正电;His 的咪唑环可在接近生理条件时发生质子化/去质子化,因此常见于酶活性位点。

5. 芳香族侧链

  • 苯丙氨酸 Phe、酪氨酸 Tyr、色氨酸 Trp。
  • 芳香环可参与疏水作用和 π–π stacking(π–π 堆积,即芳香环之间的非共价相互作用)

三、容易混淆的缩写

氨基酸三字母单字母记忆提示
天冬氨酸AspDA 已给丙氨酸;D 可联想到 aspartate 的尾部发音
谷氨酸GluEE 可联想到 glutamate 末尾的 e
天冬酰胺AsnNN 来自 asparagine
谷氨酰胺GlnQG 已给甘氨酸;Q 是 glutamine 的约定代码
赖氨酸LysKL 已给亮氨酸;K 是历史约定代码
苯丙氨酸PheFF 对应 phenyl 的 /f/ 音
色氨酸TrpWT 已给苏氨酸;W 是历史约定代码

四组对应关系

  • 酸与酰胺:Asp(D)→ Asn(N);Glu(E)→ Gln(Q)。
  • 含硫:Cys(C)有巯基;Met(M)有硫醚。
  • 含羟基:Ser(S)、Thr(T)、Tyr(Y)。
  • 芳香族:Phe(F)、Tyr(Y)、Trp(W)。

四、立体化学与蛋白质结构提示

  • 除甘氨酸外,标准 α-氨基酸的 α-碳通常都是手性中心;天然蛋白质主要采用 L-configuration(L-构型,相对于甘油醛建立的立体化学构型)
  • 苏氨酸和异亮氨酸各有两个手性中心。
  • 脯氨酸的环状结构降低肽链局部柔性,常影响转角和二级结构。
  • 半胱氨酸氧化后,两分子可形成含二硫键的胱氨酸:
2CysSH    CysSSCys+2H++2e2\,\mathrm{Cys{-}SH}\;\rightleftharpoons\;\mathrm{Cys{-}S{-}S{-}Cys}+2\mathrm{H^+}+2\mathrm{e^-}

五、在 NCA 合成与多肽聚合中的意义

NCA(N-carboxyanhydride,N-羧基酸酐)是氨基酸衍生的五元环单体,可用于开环聚合制备多肽。选择氨基酸单体时,需特别关注侧链官能团:

  • Lys、Glu、Asp、Ser、Thr、Tyr、Cys 等侧链通常需要合适的保护策略。
  • Phe、Leu、Val、Ile 等疏水侧链会影响单体溶解性、聚合物构象和组装行为。
  • His 的咪唑、Cys 的巯基以及酸性侧链可参与金属配位或后续偶联,但也可能干扰聚合条件。

命名来源的边界 氨基酸名称多形成于 19—20 世纪早期,不同资料对个别名称的具体历史细节可能有不同表述。上表保留最常见且与结构或发现史直接相关的解释;如用于论文,请进一步核对化学史原始文献或权威词源资料。

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